溯源上游:MSC细胞质量如何决定外泌体的关键质量属性与治疗潜力

发布来源:华龛生物

发布时间:2026.07.02

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近年来,间充质干细胞(Mesenchymal Stem/Stromal Cells, MSC)来源的细胞外囊泡(Extracellular Vesicles, EVs),尤其是外泌体(Exosomes

然而,随着产业化进程的加速推进,一个根本性的质量挑战日益凸显:不同实验室、不同供体、不同生产批次之间,MSC外泌体的治疗效力差异悬殊,严重制约了其向严肃医疗应用的转化。根据Na等人(2026)在《细胞外囊泡杂志》(Journal of Extracellular Vesicles)发表的最新政策性综述,中国目前是全球第二大EVs临床试验注册国,其中超过95%的治疗性EVs研究采用天然干细胞来源,MSC占比约60%。但现阶段,国内尚未出台适配这类创新疗法的专项监管指导规范。


这一质量危机的本质,并非下游纯化技术的不成熟,而是一个尚未得到充分重视的上游命题:外泌体是MSC生理状态的“分子快照”。如果MSC处于衰老、代谢失调、遗传不稳定或培养微环境失控的状态,其分泌的外泌体将忠实地继承这些功能缺陷。这一认识正在推动行业发生一次关键的范式转移——从“是否有外泌体”走向“MSC质量是否足以保证外泌体的关键质量属性(Critical Quality Attribute, CQA)”。


本文将在国家卫生健康委员会发布的《细胞组分及衍生物治疗新技术临床研究备案指引》(2025,以下简称《备案指引》)与国际细胞外囊泡学会(ISEV)MISEV2023指南(Welsh et al., 2024)的监管框架下,系统解析MSC质量属性对外泌体CQA的多维影响,并重点评估不同生产平台的质量控制能力,以期为外泌体产品的CMC开发提供科学参考。


一、理论框架:MSC质量属性与外泌体CQA的双向映射


理解MSC质量与外泌体质量之间的关系,首先需要建立一条清晰的逻辑链:

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这条逻辑链并非线性简单映射,而是一个高度非线性的系统性输出关系——MSC的来源特异性、供体年龄与代谢健康状态、体外传代过程中的衰老积累、培养微环境的物理化学参数,以及生物反应器所施加的机械应力,共同决定了外泌体的蛋白质组、miRNA载量、脂质组成乃至囊泡亚型分布。


Na等人(2026)在其政策综述中明确提出,对于以EVs生产为目的的干细胞,其质量评估标准与单纯用于细胞治疗的MSC存在根本差异:前者需要额外评估EVs平均分泌水平、跨代次EVs产量稳定性以及EVs功能货物的批次一致性。这一观点具有重要的CMC指导意义——它意味着,一株通过国际细胞治疗学会(ISCT)传统标准认证的MSC,完全有可能在EVs生产质量方面表现不合格。


《备案指引》同样强调了工艺研究与质量研究的关联性,要求对起始细胞的特性、培养工艺参数以及产品关键质量属性之间的关系进行系统表征。这与ICH Q8(药物研发)中"质量源于设计"的理念高度一致:只有深入理解上游MSC质量对下游EVs产品CQA的影响,才能建立真正有效的过程控制策略。


二、MSC组织来源:外泌体功能方向的生物学起点


MSC并非一种同质化的细胞类型,而是依据其组织来源呈现出显著的生物学异质性。骨髓(BM-MSC)、脂肪(AD-MSC)、脐带/华通氏胶(UC/WJ-MSC)、胎盘以及牙髓来源的MSC,在蛋白质组构成、miRNA谱系及功能倾向上均存在实质性差异。重要的是,这种差异会直接传递至其分泌的外泌体。文献报道显示,不同来源MSC外泌体的蛋白质组重叠率仅约60%,这意味着"MSC外泌体"作为一个统称,在科学上过于宽泛(Almeria, 2022)。


就产业化价值而言,UC-MSC因其非侵入性的获取方式、更年轻的供体表型、较低的衰老负担以及更适合建立GMP级细胞库的一致性,正成为行业主流选择。Na等人(2026)的临床数据亦表明,在中国注册的治疗性EVs研究中,脐带来源MSC占已知来源的44%,与骨髓来源并列第一。同时,AD-MSC外泌体因其突出的促血管生成和促创面愈合活性,在特定适应症,如缺血性疾病、皮肤损伤修复中具有独特优势。


然而,组织来源的选择应遵循"适应症-来源匹配"的逻辑,而非简单追求某一单一来源。骨修复与骨髓MSC的成骨信号优势匹配,系统性炎症修复与脐带MSC的免疫调节优势匹配,血管再生则与脂肪MSC的促血管生成分子优势匹配。在CMC层面,无论选择哪一来源,建立标准化、特征化的主细胞库(MCB)与工作细胞库(WCB),均是保障批次间EVs质量一致性的前提条件(Na et al., 2026)。


三、MSC质量的多维决定因素:什么样的MSC,产出什么样的外泌体


MSC外泌体的质量劣化,远不止于"传代次数过高"这一单一因素,而是由多个上游质量维度的系统性失调所共同决定。理解这一多维机制,是建立科学的过程控制体系的理论基础。


3.1、细胞代次与复制性衰老:功能衰减的量化基线

MSC的复制性衰老是影响外泌体质量最为直接且可量化的参数。随着体外传代次数增加,MSC逐步积累DNA损伤、端粒缩短、线粒体功能障碍以及氧化应激,激活衰老相关分泌表型(Senescence-Associated Secretory Phenotype, SASP)。这一细胞状态的改变,会系统性地重塑其分泌的外泌体miRNA载量,引发所谓的"衰老相关miRNA重编程"(senescence-associated miRNA rewiring)。


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基于上述机制,可以建立一个具有CMC应用价值的分析框架——"再生指数/衰老指数比值":以miR-126、miR-210、miR-199b-3p、miR-145-5p和miR-335-5p的综合水平代表再生效能,以miR-34a、miR-21和miR-155代表SASP/炎症负荷,两者比值的持续监测可作为外泌体批次质量的功能性预测指标。


值得特别强调的是:高代次MSC可能依然满足ISCT规定的表面标志物标准(CD73+/CD90+/CD105+),却已产生效力显著衰退的外泌体。这一现象被认为是当前商业化开发中最为严重的盲点之一。


3.2、供体质量与代谢状态:外泌体功能的先天底色

供体的生理状态会对MSC质量形成持续性的“生物学印记”。老年供体的MSC普遍表现出增殖能力下降、线粒体功能障碍、活性氧(ROS)水平升高以及表观遗传漂变(epigenetic drift),其外泌体的促血管生成能力和免疫调节效能均显著受损。在病理状态方面,糖尿病供体的MSC所产生的外泌体,其促血管生成miRNA载量明显降低;而肥胖供体MSC则可能产生具有促炎倾向的EVs(Cell & Bioscience, 2022)。


从代谢角度来看,MSC存在两种截然不同的代谢状态,并对应不同的外泌体分泌谱:处于糖酵解主导状态(干细胞样表型、低氧适应)的MSC,其EVs富含miR-210、miR-126等促再生miRNA,具有更高的治疗效能;而处于氧化磷酸化(OXPHOS)主导状态(衰老、应激)的MSC,其EVs中miR-34a、miR-155等SASP相关分子上调,再生潜力下降乃至向促纤维化方向偏转。这一发现提示:培养微环境的溶氧控制,不仅是细胞存活参数,更是外泌体功能性CQA的主动调控手段。


3.3、缺氧坏死核心的外泌体质量风险:一个被严重低估的GMP隐患

在高密度MSC培养体系(尤其是固定床生物反应器)中,载体内层的细胞因营养物质和溶氧扩散受限,可能陷入严重缺氧乃至坏死状态,形成所谓的"坏死核心"(necrotic core)。这一现象对外泌体产品质量具有深刻且被严重低估的负面影响。


处于坏死或凋亡应激状态的MSC,会大量释放凋亡小体(apoptotic bodies)——一类直径500–5000 nm的EVs亚型,其内容物与治疗性外泌体截然不同:碎片化细胞核DNA、受损细胞器、组蛋白以及高免疫原性信号分子。凋亡小体进入收获液后,若未经充分分离,将直接污染产品批次,引发以下质量问题:


强烈的促炎信号效应,与外泌体预期的抗炎治疗效果相悖;

免疫原性风险显著升高,可能触发非预期的适应性免疫反应;

核酸污染增加下游安全性评估的复杂度(van Niel et al., 2022)。


更为关键的是,坏死核心中细胞分泌的功能受损外泌体与正常细胞分泌的治疗性外泌体,在常规颗粒数检测(NTA)或粒径分布分析中难以区分。这意味着即便最终产品通过了基本的理化表征,其生物活性已可能因上游细胞状态的失控而大打折扣。从Na等人(2026)提出的质量评价框架可以推导出,EVs亚型纯度是评估产品均一性的关键考量,仅依靠颗粒计数而不结合功能效力检测,无法充分反映EVs产品的安全性与有效性。


3.4、物理刺激对外泌体质量的调控作用:生物反应器参数的隐性影响


Wu等人(2024)在《细胞增殖》(Cell Proliferation)发表的系统性综述,全面梳理了物理调控手段对MSC外泌体质量的干预效应,为生物反应器工艺参数设计提供了重要的科学依据。


流体剪切力是生物反应器中最具代表性的物理参数。适度的层流剪切力可通过激活整合素-YAP/TAZ机械感应通路,上调外泌体中促再生miRNA的富集水平;然而,过高的湍流剪切力(如搅拌桨设计不当)则会诱导MSC向机械应激状态转变,使EVs亚型分布向微囊泡偏移,稀释治疗性外泌体的比例,并可能损伤囊泡膜完整性(Wu et al., 2024)。


基底刚度同样是不可忽视的物理参数。MSC对基底力学信号的感知,通过整合素-黏着斑复合体直接影响细胞骨架组织,进而调控内体多囊泡体(MVB)的成熟与ESCRT介导的外泌体生物合成途径。较软的仿生基底(接近天然软组织的1–10 kPa范围)有助于维持MSC的干细胞表型,而过硬的基底则可能加速其向成骨方向分化,改变外泌体的功能性货物组成(Wu et al., 2024)。


此外,低氧预处理作为一种被广泛研究的功能增强策略,通过激活HIF-1α通路,可系统性上调外泌体中促血管生成miRNA(miR-210、miR-126、miR-26a)的表达,在缺血性损伤、心肌保护等适应症中显示出显著的疗效增强效果(Zhuo, 2024)。然而,值得警惕的是,一项2026年系统综述指出,在肿瘤相关环境中,低氧预处理的MSC外泌体可能具有促进肿瘤血管生成和抑制凋亡的潜在风险(Seddighi, 2026),提示适应症特异性的安全性评估在功能增强策略中不可或缺。


3.5、SASP分泌组的“旁观者效应”


衰老MSC分泌的EVs所携带的SASP相关miRNA(如miR-34a、miR-21、miR-155),能够在受体细胞中诱发继发性衰老,即所谓的"旁观者效应"(Ahmadi, 2021)。体外实验已在肾小管细胞、心肌细胞等多种靶细胞中观察到携带SASP相关货物的外泌体可诱导纤维化标志物(TGF-β、α-SMA)上调,并抑制受体细胞的增殖能力(Devulder, 2025; Mensa, 2020; Zhong, 2025)。


这一发现对GMP生产具有重要启示意义:若生产批次中存在一定比例的衰老MSC,其分泌的SASP-EV将以无法被常规颗粒质控检测识别的方式污染整个批次,造成潜在的安全性隐患。这进一步支持了将"衰老负荷"纳入生产过程控制参数的必要性。


四、培养工艺系统性比较:质量可视性是工艺选型的核心维度

基于前述对MSC质量多维决定因素的分析,工艺平台的评估逻辑应当发生根本性转变:不能仅以产量高低作为优劣判断的依据,而必须将一个核心问题置于首位——该平台能否实时感知并主动控制MSC的质量状态,从而保障外泌体CQA的批次一致性。


以下从多个维度对主流平台进行系统性比较,并重点分析可降解微载体3D悬浮培养系统相较于其他平台的结构性质量优势。


表1 主流MSC-EV生产平台多维质量评估对比矩阵

评估

维度

2D平面

培养

固定床

反应器

中空纤

维系统

3D可降解微载体

(悬浮生物反应器)


EVs产量

(相对基准)


1×基准

↑↑

↑↑↑

↑↑↑(可达7.5–140×)


MSC质量可视化


高(直接镜检)

极低

(黑盒)

低

(密闭)

中-高

(可定期取样)


坏死核心

风险


无

高(填料内层缺氧)

中等

低

(悬浮均一分布)


剪切力

均一性


N/A

不均一

较均一

可精准控制


细胞收获

应激


低(标准消化)

中-高(反复消化)

高(压力释放)

极低

(载体可降解,免消化)


GMP放大

适配性


差

中

中z

优


批次一致性


差(难以放大)

中

中

高


4.1、固定床生物反应器的结构性质量缺陷

固定床生物反应器的核心问题在于其"质量黑盒化"特征。不可降解固体填料构成的密闭三维空间,使得内层细胞长期面临溶氧梯度(外层高氧/内层缺氧乃至坏死)、营养物质扩散受限以及代谢废物积累等系统性微环境失调。由于无法对不同空间位置的细胞进行直接的形态学观察、活性检测与代谢分析,整个培养体系的MSC质量状态完全无法实时感知。


从外泌体质量控制的视角审视,这一结构性缺陷意味着:坏死区域细胞所产生的凋亡小体与功能低下的EVs亚型,将与正常细胞来源的治疗性外泌体一同进入收获液,在收获阶段难以有效区分和排除。不可降解载体在传代传递时还需反复酶消化,胰蛋白酶处理造成的细胞表面标志物损伤和代谢应激,进一步扰乱外泌体的分泌谱(Haraszti et al., 2018)。


4.2、中空纤维系统的局限性

中空纤维生物反应器通过将细胞包裹于纤维内腔实现高密度培养,EVs产量较高,但存在与固定床类似的"质量不可视"问题:高密度细胞层内的微环境难以精确控制,EVs产物与细胞代谢废物(包括潜在的凋亡碎片)共同积累于纤维间质空间,收获液的成分复杂性给下游纯化带来更高负担;此外,中空纤维系统的放大逻辑受到纤维面积的物理限制,难以实现真正线性规模化。


4.3、可降解3D微载体:兼顾产量、质量可控性与GMP适配性的系统性优势

Lenzini等人(2025)在美国细胞与基因治疗学会(ASGCT)年会暨《细胞治疗》(Cytotherapy)杂志上发表的跨平台比较研究,对不同组织来源和生产平台下MSC-EV的质量属性进行了系统性分析比较,为工艺平台选型提供了重要的分析性依据。该研究揭示,生产平台的选择对EVs的粒径分布、表面标志物表达稳定性以及批间一致性均具有显著影响,尤其是在细胞收获方式上,无需酶消化的可降解微载体平台在维持EVs功能性cargo的完整性方面表现出明显优势。


可降解微载体悬浮培养体系的质量控制优势可从以下四个维度进行理解:

第一,避免坏死核心。微载体以小颗粒形式均匀悬浮于生物反应器中,细胞生长于微载体表面,营养物质和溶氧可通过搅拌实现均匀供给,从根本上避免了固定床体系中溶氧梯度与坏死区域的形成。


第二,质量状态可实时监控。由于培养体系为悬浮液,可在任意时间点取样,对MSC进行形态学观察、细胞活力检测(如AO/PI法)、表型分析(流式细胞术)及代谢参数监测(如葡萄糖消耗、乳酸产生),从而维持对MSC质量状态的持续感知能力。


第三,免胰酶消化收获,降低细胞应激。可降解微载体可在收获阶段通过温和水解逐步降解,MSC无需经历反复的胰蛋白酶消化过程。消化本身会诱导细胞膜损伤、激活应激信号通路,导致EVs分泌谱发生瞬时性改变;而可降解载体的使用,使细胞在收获阶段维持更自然的生理状态,有助于保持EVs功能性货物的完整性(Haraszti et al., 2018)。


第四,物理参数的精确工程化控制。3D悬浮培养体系中,搅拌速度、溶氧设定点等关键物理参数均可精确设定和记录,使剪切力在符合适度机械刺激有益窗口(激活YAP/TAZ促进EVs分泌)的前提下实现批间重现,为外泌体物理刺激响应的稳定性提供工艺保障(Wu et al., 2024)。


华龛生物自主研发的3D FloTrix® 细胞规模化培养技术,正是基于上述质量控制逻辑构建的产业化解决方案。其采用3D TableTrix® 及 3D RecomTrix® 可降解三维多孔微载体,为MSC提供高度仿生的立体培养微环境,在维持细胞贴壁生长天然生态位的同时,使用3D FloTrix® 系列生物反应器实现了高效悬浮扩增。配合成分限定收获培养基,3D FloTrix® 系统可在外泌体生产的关键收获阶段,将培养基来源的外泌体干扰降至最低,有助于满足Na等人(2026)和备案指引对上游细胞质量与下游EVs产品CQA关联表征的监管要求。



五、收获工艺的精细化设计:两阶段培养基策略与多次收获的科学考量

确立了高质量的上游MSC培养平台之后,收获阶段的工艺设计是将MSC质量转化为可控外泌体产品质量的关键环节。


5.1、两阶段培养基策略:效率与纯度的工程化平衡

扩增阶段与收获阶段对培养基的需求存在根本性差异,"一培养基贯通全程"的策略在外泌体生产中是不可接受的,一个经过验证的合理策略是:


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这一切换的科学依据在于:含血清或血小板裂解物的培养基本身携带大量来源于供体来源的EVs,若不加清除,这些外源性EVs将直接进入条件培养液,成为EVs产品中无法与MSC来源EVs区分的蛋白质组杂质。Na等人(2026)在其外泌体质量评估框架中明确指出,培养基来源的外源性蛋白质和核酸组分,是影响EVs制品纯度与安全性的重要潜在污染源,应通过适当的分析检测加以排除污染的存在。


5.2、多次收获策略的可行性与质量管理考量

多次收获策略——即在同一批MSC上进行多轮上清液收集——在理论上具有显著提高单批产量的吸引力,但其可行性取决于能否在多轮收获之间保持MSC质量状态的稳定性,从而维持EVs功能性CQA的批间一致性。


从已有证据来看,需要重点评估以下几个方面:

其一,EVs分泌速率的时程稳定性:随着无血清/无外源EV培养基暴露时间延长,部分研究报道MSC的增殖活性与EVs分泌效率会逐步下降,需要明确"效率窗口"范围;

其二,miRNA载量的批间一致性:多轮收获之间的EVs组学(miRNA谱、蛋白质组)稳定性需通过系统性功能比对加以验证,而非仅依赖颗粒数作为一致性指标;

其三,细胞衰老累积风险:延长的体外操作时间本身即是SASP诱发风险因素,需通过定期SA-β-gal染色和p21/p16基因表达检测对衰老负荷进行监控。


MISEV2023(Welsh et al., 2024)指出,EVs生产过程的稳健性和批次一致性是临床转化的核心要求,生产过程中的每个步骤均需经过系统性工艺表征。这一原则同样适用于多次收获工艺的验证设计。


六、将MSC质量纳入过程控制参数体系:从监管要求到工艺实践

综合上述分析,将MSC质量参数系统性地纳入外泌体生产的过程控制体系,是保障EVs产品质量稳定性的核心工程挑战。这一要求与备案指引关于"工艺研究应明确关键工艺参数及其与产品关键质量属性之间关系"的规定高度吻合,也与ICH Q8/Q10的质量源于设计理念一致。


基于本文的系统性分析,建议将以下MSC质量属性纳入关键过程参数(Critical Process Parameters, CPP)的监控框架。


在细胞身份与活性参数方面:细胞活力(目标≥90%)、表型标志物(CD73+/CD90+/CD105+稳定性)、代次记录与传代历史(建议设定最大传代上限)。


在衰老监控参数方面:SA-β-半乳糖苷酶(SA-β-gal)阳性率,作为衰老负荷的功能性检测指标;p21/p16 mRNA表达水平作为分子水平的衰老标志;EVs分泌速率(单位细胞/单位时间的EVs颗粒数)作为细胞分泌功能的连续性监控参数。


在EVs功能性CQA参数方面:以再生轴miRNA(miR-126, miR-210)与衰老轴miRNA(miR-34a, miR-21)的表达水平比值作为批次功能质量指标;在适应症相关的细胞功能测试中,验证外泌体的免疫调节能力(如巨噬细胞M2极化诱导活性)或促血管生成活性。Na等人(2026)亦指出,效力检测(potency assay)应作为机制相关的生物活性替代指标,而非依赖粒径和颗粒数等物理参数替代功能评估。


Na等人(2026)针对EVs产品细胞库的质量控制框架为上述参数体系的建立提供了规范性参照:从原代细胞库(PCB)到主细胞库(MCB)再到工作细胞库(WCB),每个层级均应在完整的基因组稳定性、生物学功能及EVs分泌特性评估的基础上建立,以确保整个生产周期内MSC质量的可追溯性和可预测性。


外泌体不是一个可以独立于其生产细胞质量而存在的药学实体,它本质上是MSC生理状态的功能性镜像。本文通过系统梳理MSC组织来源、细胞代次与衰老、坏死核心风险、物理刺激效应以及SASP质量传染等多维度的上游质量决定因素,揭示了一个简单却深刻的制造逻辑:劣质的MSC无法稳定产出高质量的外泌体。


在培养工艺层面,本文的分析表明,不同平台在"MSC质量可视性"这一核心维度上存在结构性差异:固定床和中空纤维系统所固有的质量黑盒化问题,使其在GMP级外泌体生产的质量可控性方面面临难以克服的挑战;而基于可降解微载体的3D悬浮培养体系,凭借其可实时监控的培养状态、均一可控的物理微环境以及免酶消化收获的细胞保护性优势,在兼顾产量规模化与质量可控性方面展现出系统性的技术优势。


从监管视角来看,无论是国内备案指引对工艺与质量关联表征的明确要求,还是ISEV MISEV2023和Na等人(2026)所呈现的国际质量评估框架,都在共同指向同一个产业化方向:外泌体的制造竞争,本质上是上游细胞质量控制能力的竞争。谁能够在MSC质量属性与外泌体CQA之间建立稳定、可量化、可重现的关联模型,谁就将在外泌体的临床转化与商业化落地中获得决定性的先发优势。


华龛生物长期致力于为MSC和外泌体产业化提供底层技术平台支持,并在3D培养技术、规模化扩增工艺以及GMP适配制造体系方面持续积累核心能力,成功支持了国内首款外泌体新药的IND受理(>>点击查看)。随着3D FloTrix® 系列产品和技术体系的持续迭代,华龛生物希望与更多志在推动外泌体严肃医疗应用的开发者携手,将"高质量MSC"作为外泌体制造的底层基础设施,共同推动这一领域从科研探索走向高标准的工程化制造。